發(fā)熱階段

在肥料生產(chǎn)初期，肥料中的微生物在中溫下.氣性好的類型主要是無芽孢細(xì)菌.孢子細(xì)菌和霉菌。它們開始發(fā)酵過程，在良好的氣性環(huán)境中分解有機(jī)物（如簡單的糖）.淀粉.蛋白質(zhì)等。)，產(chǎn)生大量熱量，不斷提高堆肥溫度，從20℃上下上升至40℃，稱為發(fā)熱階段，或中溫階段。

高溫階段

隨著溫度的升高，熱微生物逐漸取代中性溫度的類型，溫度繼續(xù)增加，一般在幾天內(nèi)達(dá)到50℃以上，進(jìn)入高溫階段。

在高溫階段，好熱放線菌和好熱真菌的熱真菌已成為主要類型。它們是復(fù)雜的有機(jī)物質(zhì)（如纖維素）.半纖維素.果膠物質(zhì)等。)強(qiáng)烈分解，熱量積累，堆肥溫度升高到60-70℃，甚至能高達(dá)80℃。

然后大多數(shù)熱微生物也死亡或進(jìn)入休眠模式(20)d以上)，這對(duì)加速堆肥的分解起著非常重要的作用。堆肥不當(dāng)，只有很短的高溫期，或根本達(dá)不到高溫，所以分解很慢，半年或更長時(shí)間不能達(dá)到半分解狀態(tài)。

減溫階段

高溫階段持續(xù)一段時(shí)間后，纖維素.半纖維素.大多數(shù)果膠物質(zhì)已經(jīng)分解，剩下復(fù)雜的成分（如木質(zhì)素）和新形成的腐殖質(zhì)，微生物活動(dòng)減弱，溫度逐漸下降。當(dāng)溫度下降到40℃時(shí)下面，中性溫微生物又成為優(yōu)勢(shì)類型。

如果降溫階段較早，說明堆積條件不理想，植物物質(zhì)分解不足。此時(shí)可以翻堆，將沉積材料混合均勻，第二次發(fā)熱.加熱，促進(jìn)肥料的腐熟。

腐熟保肥階段

堆肥成熟后，體積縮小，堆積溫度略高于溫度。此時(shí)，應(yīng)將堆肥卡緊，導(dǎo)致厭氣狀態(tài)，削弱有機(jī)礦化作用，有利于保護(hù)肥料。

堆肥實(shí)際上是廢物穩(wěn)定的一種形式，但這需要特殊的濕度.通風(fēng)條件和微生物產(chǎn)生適宜的溫度。研究發(fā)現(xiàn)，在一定溫度下加熱一段時(shí)間會(huì)破壞病原菌.雜草種子。通常在60-70℃(寒濕)溫度下，加熱5-10min（分鐘）。能破壞非孢子細(xì)菌和孢子細(xì)菌的非休眠體活性。采用加熱滅菌，70分鐘內(nèi)，℃環(huán)境下加溫30min(分鐘)能消除污泥中的病原菌。

但在較低溫度下(50-6000℃)，有些病原菌可以消滅近60種d。因此，在脫肥過程中保持600℃上述溫度需要一段時(shí)間。合理堆肥后殘留有機(jī)物分解率低.比較穩(wěn)定，容易被植物吸收。脫肥后可大大降低異味。

堆肥有機(jī)質(zhì)的礦化可為作物和微生物提供快速營養(yǎng)，為微生物活動(dòng)提供能量，為堆肥有機(jī)質(zhì)的腐殖化準(zhǔn)備基本原料。

當(dāng)有機(jī)物迅速礦化并產(chǎn)生更多的二氧化碳時(shí)，有機(jī)物主要是氣性微生物活動(dòng).水等營養(yǎng)物質(zhì)分解迅速完全，釋放大量熱能；當(dāng)涉厭氧微生物物活動(dòng)時(shí)，有機(jī)物分解緩慢，通常不到位，熱能釋放較少。除了植物營養(yǎng)物質(zhì)，其分解產(chǎn)物還容易積累有機(jī)酸和CH4.H2S.PH3.H2等還原性物質(zhì)，當(dāng)達(dá)到一定程度時(shí)，對(duì)作物生長不利甚至有害。

因此，堆肥發(fā)酵階段的堆肥也是為了改變微生物活動(dòng)的類型，以去除有害物質(zhì)。

各種生物在堆肥過程中.微生物的死亡.更換和物質(zhì)形態(tài)轉(zhuǎn)換是同步進(jìn)行的，無論是從熱學(xué)開始，.從生物學(xué)或物質(zhì)轉(zhuǎn)化的角度來看，這些反應(yīng)不能在幾天或十天內(nèi)完成，這就是為什么即使是各種溫度.濕度.水分.在微生物等條件得到很好控制的前提下，脫肥還需要45-60天。